前列腺癌易感位点rs2252004的eQTL和meQTL研究

• 作者: 储海燕 张正东 王美林 葛雨秋 邵卫 金经 马高祥
• 来源期刊: 南京医科大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: rs2252004 甲基化 FGFR2 前列腺癌
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 31-33,87
• 页数: 4页
• 分类号: R737.25
• 语种: 中文
• DOI: 10.7655/NYDXBNS20180107

摘要

目的:全基因组关联性研究(GWAS)发现rs2252004与前列腺癌的易感性相关,本研究拟进一步探讨rs2252004参与前列腺癌发生的可能分子生物学机制.方法:运用TCGA公共数据库中的基因型、甲基化、基因表达数据,采用线性回归分析rs2252004基因型与其上下游1 Mb区域CpG位点的甲基化水平及相关基因表达的关联性.结果:rs2252004与FGFR2基因上的3个CpG位点的甲基化水平显著相关(cg25294906,P=0.031;cg03552039,P=0.042;cg16499947,P=0.049).而FGFR2在50例配对的前列腺癌组织和癌旁组织中表达差异有统计学意义(P=9.3×10-11).与GG基因型相比,rs2252004 GT基因型的前列腺癌患者的FGFR2基因表达量显著降低(P=0.007).此外,GT/TT基因型与GG基因型患者的FGFR2表达量差异有统计学意义(P=0.006).结论:rs2252004可能通过影响FGFR2甲基化水平,进而调控FGFR2基因的表达,从而参与前列腺癌的发生.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张正东		44	222	7.0	13.0
2	储海燕		9	26	3.0	4.0
3	王美林		22	52	4.0	5.0
4	邵卫		3	1	1.0	1.0
5	葛雨秋		2	1	1.0	1.0
6	金经		1	0	0.0	0.0
7	马高祥		2	1	1.0	1.0