16S rDNA特异性引物设计优化及其在淞江鲈体表微生物鉴定中的应用

• 作者: 何恩明 周雁 张亮 徐鹏昊 王焱磊 王金秋 窦同海 罗武松 蔡枫
• 来源期刊: 复旦学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 引物设计 特异性 菌群分析 淞江鲈
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 页码范围: 59-67,78
• 页数: 10页
• 分类号: Q933
• 语种: 中文

摘要

引物与模板的结合特异性是PCR反应成功与否的主要决定因素之一.在进行以16s rDNA为目标序列的菌种鉴定或者各种检测应用中,对引物的特异性具有较普遍的要求.需扩增出完整的目标属,实现属内保守,同时避免有效扩增其他属的相应序列即实现属间特异.对此,我们对引物设计进行优化,通过分析所有已知细菌16s rDNA序列,针对特定目标属筛选特异和最高效的引物对,并在淞江鲈的体表菌群样品中进行验证实验.结果表明,所设计的引物具有较好的属内保守性和特异性,而且引物在扩增中的效率也有一定的保证,能够很好地应用于菌群的定量PCR分析.