上皮卵巢癌细胞系LncRNAs、mRNAs表达谱基因芯片分析

• 作者: 于骏 叶庆 吴成将 张勤勤 张璐玢 杨佩芳 杨鑫鑫 沈蓉 王荟 邵启祥 闫美娜 陈淼
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 上皮卵巢癌 LncRNA 基因芯片
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 研究生园地
• 页码范围: 384-387,400
• 页数: 5页
• 分类号: R737.31
• 字数: 835字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2018.05.17

摘要

目的 通过基因芯片分析上皮卵巢癌细胞系中差异表达的LncRNAs、mRNAs表达谱,为研究上皮卵巢癌相关LncRNAs的功能提供实验依据.方法 采用基因芯片分析上皮卵巢癌细胞系A2780、HO8910、SKOV3与卵巢上皮细胞系HOSEpiC中LncRNAs和mRNAs的表达差异;对差异表达的mRNAs进行KEGG通路富集分析;用qRT-PCR在上皮卵巢癌细胞系及卵巢上皮细胞系中验证差异明显的6条LncRNAs的表达水平.结果 基因芯片结果发现在3个肿瘤细胞系中上调的LncRNAs有227条,下调的有483条;3个上皮卵巢癌细胞系中差异表达的mRNAs主要富集在PI3K-AKT、mTOR及TNF-α等肿瘤相关通路中(P<0.05);PTPRG-AS1、CCNT2-AS1、XLOC 009869、LINC01138在上皮卵巢癌细胞系A2780、SKOV3、和OVCR3中表达上调(P<0.05);RP11-252P19.2、RP11-744I24.2在上皮卵巢癌细胞系A2780、SKOV3、HO8910、OVCR3和3AO中表达下调(P<0.05).结论 基因芯片筛选出在上皮卵巢癌细胞系中差异表达的LncRNAs和mRNAs,差异表达mRNAs与PI3K-AKT、mTOR及TNF-α等肿瘤通路有关,有望为卵巢癌的诊断及治疗提供新的靶点.