Analysis of mechanism on Indigo Naturalis in treating chronic myelocytic leukemia based on two-dimentional model of protein-protein interaction network-moleculardocking technique

• 作者: Chao Zhou Cun Liu Hong Liu Jing Zhuang Li-Juan Liu Xiao-Ming Zhang
• 来源期刊: TMR理论与假说
• 学科: 医学
• 关键词: 青黛 慢性粒细胞白血病 蛋白质 相互作用网络 分子对接
• 年，卷（期）: tmrllyjs_2018,（1）
• 页码范围: 13-17
• 页数: 5页
• 分类号: R

摘要

运用分子对接技术探讨青黛干预CMLK562细胞的有效分子学机制.使用在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）筛选CML相关基因,使用String10.0用于进一步文本挖掘并构建CML可视化蛋白质相互作用网络,将数据读入Cytoscape3.4.0,通过插件CentiScaPe2.1实现网络拓扑分析.青黛活性小分子物质从第三方数据库获取,运用Chemoffice8.0与Sybyl8.1对其再构建和优化,得到青黛小分子配体结构库,通过SurflexDock模块与受体革巴点进行分子对接,打分后得到关键靶标.构建了由425个节点（蛋白质）和2799条边（相互作用）组成的蛋白质相互作用网络,分析得出关键靶标JAK2.CML是一个受多基因调控的复杂疾病,JAK2很可能是其关键节点.