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摘要:
运用分子对接技术探讨青黛干预CMLK562细胞的有效分子学机制.使用在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)筛选CML相关基因,使用String10.0用于进一步文本挖掘并构建CML可视化蛋白质相互作用网络,将数据读入Cytoscape3.4.0,通过插件CentiScaPe2.1实现网络拓扑分析.青黛活性小分子物质从第三方数据库获取,运用Chemoffice8.0与Sybyl8.1对其再构建和优化,得到青黛小分子配体结构库,通过SurflexDock模块与受体革巴点进行分子对接,打分后得到关键靶标.构建了由425个节点(蛋白质)和2799条边(相互作用)组成的蛋白质相互作用网络,分析得出关键靶标JAK2.CML是一个受多基因调控的复杂疾病,JAK2很可能是其关键节点.
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文献信息
篇名 Analysis of mechanism on Indigo Naturalis in treating chronic myelocytic leukemia based on two-dimentional model of protein-protein interaction network-moleculardocking technique
来源期刊 TMR理论与假说 学科 医学
关键词 青黛 慢性粒细胞白血病 蛋白质 相互作用网络 分子对接
年,卷(期) 2018,(1) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 13-17
页数 5页 分类号 R
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青黛
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TMR理论与假说
季刊
2538-130X
天津市河东区大直沽中路伯苓大厦B座906
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