草酸钙结石晶体粘附对人肾上皮细胞lncRNA表达谱的影响

• 作者: 孙睿 张圣平 张建文 张颖 梁辉 植凡 王铸 胡七一 邓琼
• 来源期刊: 现代泌尿外科杂志
• 关键词: 草酸钙结晶 肾结石 lncRNA RNA seq
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 52-56,76
• 页数: 6页
• 分类号: R692
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-8291.2018.01.015

摘要

目的 比较分析肾结石草酸钙晶体对人肾上皮细胞IncRNA的表达谱的影响,筛选差异表达的IncRNA并初步探讨其与肾结石的关系.方法 选取临床经结石成分分析为草酸钙的肾结石标本,充分研磨后配制草酸钙晶体悬液处理人肾上皮细胞HK-2细胞,通过MTT法测定草酸钙晶体对HK-2细胞生长的影响;提取总RNA并通过高通量转录组测序平台HiSeq 2500进行lncRNA表达谱差异性分析.对筛选获得的差异lncRNA进行Real-Time PCR验证,并通过Gene Ontology数据库和KEGG信号通路初步分析其功能.结果 草酸钙晶体在数分钟内便粘附于HK-2细胞表面,并且显示出明显的细胞毒性,细胞生长速度减慢且引起细胞形态以及培养基pH值发生显著改变.RNA seq结果显示经草酸钙晶体处理后的HK-2细胞中差异表达的lncRNA有25个,其中上调表达的9个,下调表达的16个.通过实时定量RT-PCR进行验证,差异均具有统计学意义(P＜0.05).结论 草酸钙结晶对人肾上皮细胞lncRNA以及mRNA表达有显著影响,并且这些lncRNA的异常表达可能与肾结石发病有关.