阿拉善双峰驼MSTN基因序列生物信息学分析

• 作者: 刘图雅 姜建强 戴钦 杨惠 白龙 阿拉腾呼依嘎 额尔敦木图
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 阿拉善双峰驼 肌肉生长抑制素(MSTN) 基因序列 蛋白质 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 41-46,248-250
• 页数: 1页
• 分类号: S852.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13881/j.cnki.hljxmsy.2017.05.0166

摘要

为了研究阿拉善双峰驼肌肉生长抑制素(MSTN)基因,进一步探讨阿拉善双峰驼MSTN基因的结构及功能,试验采用5对引物对阿拉善双峰驼MSTN基因进行PCR扩增,所得产物进行序列拼接,利用生物信息学方法对阿拉善双峰驼MSTN基因的结构、理化性质及其编码蛋白信号肽、跨膜位置、亚细胞定位等进行分析,并讨论了阿拉善双峰驼与其他物种MSTN氨基酸序列的进化关系.结果表明:阿拉善双峰驼MSTN基因长7.3 kb,1～581 bp为第一外显子区,2 384～2 757 bp为第二外显子区,4 800～6 737 bp为第三外显子区.阿拉善双峰驼MSTN蛋白属于疏水性不稳定蛋白,18～19位氨基酸是最有可能的剪切位点,作为信号肽的可能性很大;二级结构中α-螺旋占22.40％,延伸链占26.67％,β-转角占7.73％,无规则卷曲占43.20％;阿拉善双峰驼MSTN蛋白有1个跨膜结构区域,其功能域可能位于278～375位氨基酸处.阿拉善双峰驼MSTN基因与哺乳类及灵长类动物的亲缘关系较近,与猪的亲缘关系最近(相似性高达99.2％).说明阿拉善双峰驼MSTN基因编码的蛋白符合一般TGF-β超家族的结构特征,并符合已知MSTN蛋白的结构特征,与猪、灵长类及反刍类动物的分子进化距离较近.