基于SLAF-seq技术的苦瓜白粉病SNP分子标记开发

• 作者: 冯诚诚 刘杏连 梁家作 王齐旭 陈小凤 黄如葵 黄熊娟 黄玉辉
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苦瓜 白粉病 SLAF-seq SNP分子标记 ARMS-PCR
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 108-115
• 页数: 8页
• 分类号: S642.5
• 字数: 5349字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2018.01.017

摘要

以高抗白粉病苦瓜MC18和高感白粉病MC105杂交构建遗传分离群体,利用SLAF-seq技术进行深度测序,开发与抗白粉病性状紧密关联的SNP分子标记.结果表明:测序共获得各样品的有效reads为10.48 Mb,获得高质量的SLAF标签91856个,其中多态性SLAF标签5502个,多态性比例为5.99％.通过对多态性SLAF标签进行关联分析,筛选出与苦瓜白粉病抗病性状紧密关联的SNP位点共29个.根据关联分析结果,通过四引物扩增受阻突变体系PCR技术进行SNP位点多态性的验证,其中Marker4542、Marker11188分子标记特异性强、灵敏度高、稳定性好,建立一套简便快捷的苦瓜SNP分型方法.该方法可对苦瓜育种材料进行分子标记辅助选择,以进一步提高苦瓜抗病育种效率.