甘蓝型油菜BnACP5基因克隆及表达分析

• 作者: 官春云 虢慧 贺慧
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝型油菜 BnACP5 基因克隆 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 页码范围: 96-101
• 页数: 6页
• 分类号: Q78|S634.03
• 字数: 4232字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2018.01.015

摘要

ACP5基因是参与植物体中脂肪酸代谢的重要基因之一,在甘蓝型油菜中该基因还未被深入研究.为了弄清楚BnACP5基因在甘蓝型油菜中的螺旋结构及功能,以湘油15为试材,采用同源克隆法得到一个与脂肪酸合成相关的基因BnACP5.BnACP5基因CDs序列长417 bp,共编码138个氨基酸.生物信息分析表明,BnACP5蛋白的相对分子质量15.25 ku,理论等电点(pI)为5.94,其不稳定参数为43.03,属于不稳定蛋白;其总疏水平均系数(GRAVY)为-0.148,是一种亲水性蛋白;不含跨膜结构,也不含信号肽序列;二级结构中含有59.42%的α螺旋、23.19%无规则卷曲、14.49%延伸链和2.90% β转角;其中18个可能是磷酸化位点;该蛋白位被定位在线粒体内;ACP氨基酸序列比对表明,植物ACP磷酸泛酰巯基乙胺结合位点周围的氨基酸序列高度保守;UPGMA聚类分析表明,BnACP5与白菜型油菜(XP 009111933.1)亲缘关系最近.荧光定量PCR结果显示,BnACP5基因的表达量在甘蓝型油菜种子发育的不同阶段呈一定规律变化,在授粉后15 d达到峰值,20 d呈下降趋势,25~35 d呈上升趋势,此后迅速下降,45 d表达量降到最低水平.由此分析得出,该基因可能与种子脂肪酸的合成有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	官春云	国家油料改良中心湖南分中心	35	511	13.0	22.0
2	贺慧	国家油料改良中心湖南分中心	1	3	1.0	1.0
3	虢慧	国家油料改良中心湖南分中心	1	3	1.0	1.0