Dof转录因子的全基因组分析揭示辣椒发育和响应生物胁迫的功能特征

• 作者: Doil Choi Hyun-Ah Lee Seon-In Yeom Seungill Kim Won-Hee Kang 孔秋生 胡震竺
• 来源期刊: 辣椒杂志
• 关键词: Dof蛋白 转录因子 全基因组 生物胁迫 辣椒
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 国外瞭望
• 页码范围: 39-50
• 页数: 12页
• 字数: 9935字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-4542.2018.02.011

摘要

Dofs(DNA-binding with one zinc finger proteins)是植物特有的转录因子家族.Dof蛋白参与许多生物过程,如植物激素的产生,种子发育和环境适应.Dof蛋白已经在多种植物中被鉴定,但在辣椒中尚未开展类似的研究.我们在辣椒中鉴定出了33个可能的Dof基因(CaDofs).为了了解CaDof基因的特征,我们分析了其系统进化关系、蛋白质基序和进化历史.我们将含有25个基序且分布在8条染色体上的33个CaDof基因分成4个族.我们发现CaDof基因的扩张可追溯到最近的复制事件.茄科种系形成之前,片段复制在CaDof家族基因中占主导地位.通过RNA-seq分析获得了CaDof基因表达谱,发现在对包括两种TMV菌株,辣椒斑驳病毒和辣椒疫霉菌的生物胁迫响应过程中,CaDof家族基因表现出了时间和病原特异性变化,这表明CaDof基因的功能具有多样性.这些结果不仅为研究Dof基因在生物胁迫中的响应提供有价值的信息,同时也有助于更好地理解Dof基因在辣椒和其他物种中的多重功能.