四倍体海岛棉LTR反转录转座子的数量与分布

• 作者: 刘震 史莹慧 张树林 彭仁海
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 海岛棉 LTR反转录转座子 分布 基因组
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 124-130
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017-0940

摘要

棉花是重要的纤维作物,在四个栽培棉种中,海岛棉纤维品质最优,了解LTR反转录转座子的数量与分布,可以促进海岛棉基因组的研究.通过综合不同方法挖掘海岛棉基因组中的LTR反转录转座子序列,并进行家族归类和数据分析.结果表明海岛棉A亚组和D亚组共有的LTR反转录转座子家族占全部家族的95％,LTR反转录转座子的Copia超家族和Gypsy超家族的分布特征有明显的不同,但相同超家族在相同亚组染色体上则表现出相似的特征.LTR反转录转座子周边基因的GO注释主要富集在结合活性、催化活性和代谢过程等方面.研究结果揭示了LTR反转录转座子在海岛棉染色体上的分布特征及其周边基因的功能富集.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭仁海	安阳工学院生物与食品工程学院	28	40	3.0	5.0
2	刘震	安阳工学院生物与食品工程学院	9	6	1.0	2.0
3	张树林	安阳工学院生物与食品工程学院	6	4	1.0	1.0
4	史莹慧	安阳工学院生物与食品工程学院	1	0	0.0	0.0