牛血液中一株新型环状病毒的分离与全基因组序列分析

• 作者: 吴健敏 廖德芳 张怡轩 李华春 李占鸿 杨恒 谢佳芮 高林
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 农学
• 关键词: 新型环状病毒 病毒分离 全基因组测序
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 动物病毒研究论著
• 页码范围: 75-84
• 页数: 10页
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文

摘要

我们从广西壮族自治区哨兵动物牛上采集的血液样本中分离到一株病毒,暂将其命名为广西环状病毒(毒株号:V172/GX/2015).病毒接种C6/36细胞后可产生明显的细胞病变,表现为细胞聚集、皱缩与脱落.高分辨率琼脂糖凝胶电泳显示,病毒基因组由10节段的双链RNA组成,在凝胶上呈现“3-4-3”的带型特征.通过全长cDNA扩增与高通量测序方法获取V172/GX/2015毒株的全基因组序列.病毒基因组大小为19 889 bp,基因节段的大小在3 996bp(Seg-1)至829 bp(Seg-10)之间,可编码VP1至VP7等7种结构蛋白以及NS1至NS3等3种非结构蛋白.对环状病毒属保守的VP1、VP3(T2)与VP7(T13)蛋白氨基酸序列分析与系统发育树分析显示,V172/GX/2015与蚊传播环状病毒Yunnan orbivirus、Peruvian horse sickness virus以及Mobuck virus具有较近的亲缘关系,氨基酸序列相似度在31.4％至69.9％之间;V172/GX/2015在系统发育树上形成了一个独立于其它环状病毒的进化分支.本研究首次报道了一种新型环状病毒在牛上的分离与全基因组序列,研究结果将进一步丰富我们对环状病毒属病毒的认知,为开展新型环状病毒的流行病学调查与致病性研究提供基础.