Illumina MiSeq高通量测序分析不同品种桑树内生细菌多样性

• 作者: 刘祎杨 吴燕燕 徐伟芳 王玲莉 罗琴 谢洁 陈凯
• 来源期刊: 蚕学通讯
• 关键词: Illumina MiSeq高通量测序 桑树 内生细菌 多样性
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 1-10
• 页数: 10页
• 字数: 5332字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-0561.2018.03.001

摘要

为了分析不同抗病性桑树品种内生细菌多样性,利用基于Illumina MiSeq的高通量测序技术,从桑椹菌核病不同抗性品种(抗性品种:长果桑与川桑7637;易感品种:新伦教与红果2号)中共获得有效序列92282条,将高于97％ 相似度的划分为一个操作分类单元(O T U),优化后得到5858个OTUs.内生细菌种群分析结果表明,变形菌门(Proteobacteria,36.10％)、厚壁菌门(Firmicutes,14.51％)、酸杆菌门(Acidobacteria,13.38％)、拟杆菌门(Bacteroidetes,11.85％)以及放线菌门(Actinobacteria,6.35％)为各品种果桑的共有优势菌门,假单胞菌属(Pseudomonas,8.01％)为其共有优势菌属,但这些优势菌群在不同品种桑树中所占的比例均有差异.内生细菌多样性分析结果表明,抗性品种川桑7637的内生细菌多样性最高,长果桑次之,而易感品种新伦教与红果2号则相对较低.研究结果显示,桑树茎内具有丰富的内生细菌资源,抗性品种的内生细菌多样性高于易感品种.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢洁	西南大学生物技术学院	21	118	7.0	9.0
2	罗琴	西南大学生物技术学院	8	22	3.0	4.0
3	陈凯	西南大学生物技术学院	3	34	2.0	3.0
4	徐伟芳	西南大学生物技术学院	2	3	1.0	1.0
5	吴燕燕	西南大学生物技术学院	1	1	1.0	1.0
6	王玲莉	西南大学生物技术学院	1	1	1.0	1.0
7	刘祎杨	西南大学生物技术学院	1	1	1.0	1.0