辣椒类甜蛋白基因家族鉴定及表达分析

• 作者: 刘潮 唐利洲 宋培兵 王德琴 王海波 韩利红
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 类甜蛋白基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 122-129
• 页数: 8页
• 分类号: S641.3
• 字数: 4917字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2018.01.018

摘要

为了在全基因组水平上了解辣椒类甜蛋白基因(TLP)家族特征,本研究通过生物信息学方法,利用辣椒基因组数据库,对筛选的28个辣椒TLP家族成员进行鉴定,对结构功能、聚类及时空表达进行分析.结果表明,辣椒TLP家族基因主要分为4种结构类型,基因分布在9条染色体上.系统发育分析结果显示,辣椒TLP家族基因属于8个聚类组,其中成员最多的聚类组5中的基因主要来自1号染色体.基因启动子区顺式作用元件分析发现多个激素响应元件、生物/非生物响应元件.时空表达分析结果表明,多数辣椒TLP家族基因在各器官和果实发育的各阶段均有较高表达,各成员在时空表达上具有器官特异性.本研究为辣椒TLP家族基因的克隆及其在植物生长及对抗胁迫方面的研究奠定了基础.