肝癌相关基因表达谱分析及TOP2A表达的临床意义

• 作者: 何其宽 余正平 周青青 朱千东 钱海鑫
• 来源期刊: 肝胆胰外科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 癌,肝细胞 预后 TCGA数据库 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 392-398
• 页数: 7页
• 分类号: R735.7
• 字数: 4762字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11952/j.issn.1007-1954.2018.05.010

摘要

目的 探讨肝细胞性肝癌(HCC)相关基因的差异表达、富集通路和蛋白互作网络,分析差异表达基因与HCC预后的关系.方法 分析TCGA数据库中HCC相关RNAseq数据,筛选差异表达基因,明确基因富集的GO和KEGG通路,构建蛋白互作网络,找到核心蛋白,通过生存分析,明确核心基因与HCC预后的关系.结果 通过纳入标准筛选268个差异表达基因,显著富集在GO:mitotic nuclear division(P＜ 0.001),cell division (P＜ 0.001)和negative regulation of growth (P＜ 0.001)及KEGG通路(hsa04110:Cellcycle) (P＜ 0.001),均与细胞分裂与增殖密切相关.通过构建蛋白互作网络,筛选核心基因TOP2A,并在临床样本中得到验证(P＜ 0.001).生存分析显示,TOP2A的表达量与总体生存时间显著负相关(P=0.002).结论 TCGA高通量数据分析是筛选肿瘤预后靶点的有效途径,TOP2A的高表达是肝细胞性肝癌预后的不良因素.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钱海鑫	苏州大学附属第一医院普通外科	228	836	13.0	16.0
2	朱千东	苏州大学附属第一医院普通外科	5	11	2.0	3.0
4	余正平	温州医科大学附属第一医院肝胆外科	11	23	3.0	4.0
7	何其宽	温州医科大学附属第一医院肝胆外科	2	8	2.0	2.0
8	周青青	温州医科大学附属第一医院手术室	1	3	1.0	1.0