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石榴PAL基因的克隆与表达分析
石榴PAL基因的克隆与表达分析
作者:
冯立娟
尹燕雷
杨雪梅
焦其庆
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
石榴
PAL
基因克隆
生物信息学
表达分析
摘要:
为探究石榴PAL基因的功能及表达特性,解析石榴呈色和褐变机理,以石榴品种泰山红和泰山三白甜为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆PAL基因全长,分析其在不同发育期的表达情况.结果表明,从泰山红果皮cDNA中克隆得到石榴PAL基因(GenBank登录号为KY094504).PAL基因ORF序列长2 205 bp,编码734个氨基酸,含有典型的苯丙氨酸和组氨酸解氨酶保守结构域、PLN02457结合位点和PLN02457超家族保守结构域;石榴PAL编码蛋白的预测分子质量为79 693.87 Da,为稳定蛋白和亲水性蛋白,存在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸3个磷酸化位点,二级结构中含有丰富的α-螺旋(47.55%)和无规则卷曲(30.52%);实时荧光定量PCR分析表明,泰山红和泰山三白甜果实发育过程中,PAL表达水平呈先降低后升高的变化趋势,泰山红果实发育各时期果皮中PAL表达水平均高于泰山三白甜;2个品种发育期果皮褐变度逐渐降低,且泰山三白甜褐变度明显高于泰山红;泰山红果实发育期果皮花青苷含量逐渐升高,泰山三白甜变化较平缓,且泰山红花青苷含量明显高于泰山三白甜.2个品种PAL基因表达量与褐变度呈显著正相关,泰山红PAL基因表达量与花青苷含量呈极显著负相关.本研究结果为揭示石榴果实呈色和褐变机理提供了理论依据.
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篇名
石榴PAL基因的克隆与表达分析
来源期刊
核农学报
学科
关键词
石榴
PAL
基因克隆
生物信息学
表达分析
年,卷(期)
2018,(7)
所属期刊栏目
植物诱变育种·农业生物技术
研究方向
页码范围
1320-1329
页数
10页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.11869/j.issn.100-8551.2018.07.1320
五维指标
作者信息
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姓名
单位
发文数
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1
冯立娟
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尹燕雷
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焦其庆
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引文网络
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期刊影响力
核农学报
主办单位:
中国原子能农学会
中国农业科学院农产品加工研究所(前中国农业科学院原子能利用研究所)
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-8551
CN:
11-2265/S
开本:
16开
出版地:
北京市海淀区圆明园西路2号农产品加工研究所
邮发代号:
创刊时间:
1987
语种:
chi
出版文献量(篇)
4988
总下载数(次)
6
相关基金
山东省自然科学基金
英文译名:
Natural Science Foundation of Shandong Province
官方网址:
http://kyc.wfu.edu.cn/second/wnfw/shandongshengzirankexuejijin.htm
项目类型:
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学科类型:
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核农学报1998
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