基于SLAF-seq技术的(鱇)浪白鱼SNP位点开发

• 作者: 冷云 周睿 左鹏翔 张文魁 李光华 武祥伟 金方彭
• 来源期刊: 水产科技情报
• 关键词: (鱇)浪白鱼 SLAF-seq SNP位点 高通量测序 分子标记
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 85-89
• 页数: 5页
• 字数: 3629字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16446/j.cnki.1001-1994.2018.02.006

摘要

为进一步开展(鱇)浪白鱼的分子生物学研究,采用SLAF-seq(specific length amplification fragmentsequencing)技术获取(鱇)浪白鱼大量多态性SLAF标签,进而通过序列分析开发一批特异性高的单核苷酸多态性(SNP)标记.试验共获得688615个SLAF标签,平均测序深度为107.73 x,其中多态性SLAF标签205138个,通过序列分析检测到487639个SNP标记.试验表明,SLAF-seq技术可较好地用于(鱇)浪白鱼SNP位点开发,其效率远远高于ISSR(inter-simple sequence repeat)、AFLP(amplified fragment length polymorphism)、RAPD(random amplified polymorphism DNA)等传统分子标记技术.从全基因组范围获得的SNP位点标记可用以进一步完成后续群体进化分析和特异性SNP标记的开发.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冷云		23	64	5.0	6.0
2	张文魁		11	37	3.0	5.0
3	李光华		34	77	5.0	6.0
4	左鹏翔		10	31	2.0	5.0
5	武祥伟		14	25	3.0	4.0
6	金方彭		13	20	2.0	3.0
7	周睿		16	26	3.0	4.0