甘蔗蔗糖磷酸合成酶基因SPS IV电子克隆及生物信息学分析

• 作者: 卢颖林 吴小斌 李奇伟 端木卜文 齐永文
• 来源期刊: 甘蔗糖业
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蔗 蔗糖磷酸合成酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究与开发
• 页码范围: 1-9
• 页数: 9页
• 分类号: S566.1
• 字数: 3394字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-9695.2018.04.001

摘要

蔗糖在植物生长发育过程中发挥重要作用,蔗糖磷酸合成酶(SPS)是蔗糖合成的关键酶之一.本研究以通过克隆获得的甘蔗SPS IV基因部分DNA序列为探针进行电子克隆,获得甘蔗SPS IV的编码区序列全长,并采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白的氨基酸组成、理化性质、亚细胞定位及高级结构等方面进行预测分析.结果表明:ScSPS IV基因编码区全长2943 bp,编码981个氨基酸,ScSPS IV 可能是不稳定的亲水性非分泌蛋白,主要表达于细胞质.遗传进化分析表明,该基因与高粱、玉米蔗糖磷酸合成酶基因同源性高.以上研究结果为ScSPS IV基因下一步进行分子克隆、功能验证和应用提供基础.