基于线粒体COⅠ的DNA条形码在对虾科种类鉴定中的研究

• 作者: 易啸 毛勇 王军 王攀攀 苏永全
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 对虾科 DNA条形码 COⅠ基因 鉴别
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 页码范围: 1-9
• 页数: 9页
• 分类号: Q785|S917.4
• 字数: 4513字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20161210664

摘要

对虾科包含有26个属,约有200多种对虾,由于同属内的对虾在形态上非常相似,只呈现细微的差别,因此使得只基于形态学对对虾科物种的鉴别非常困难.为确定DNA条形码技术在对虾科物种鉴别的可行性,本研究中,采用线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因研究了32种对虾的核苷酸组成、对虾种间及种内遗传距离,用邻接法构建32种对虾COⅠ基因序列系统发生树.结果显示,对虾COⅠ基因组成偏倚明显,A+T含量(61.5%)显著高于G+C(38.5%).基于Kimura双参数模型计算,32个物种的种内平均遗传距离为0.003,种间平均遗传距离(0.468)是种内遗传距离的156倍,符合Hebert提出的种间遗传距离大于或等于10倍种内遗传距离的标准.在系统进化树中,32种对虾中有30种对虾都以较高的置信度聚合成独立的分支.可见,线粒体COⅠ基因作为对虾科DNA条形码在物种的鉴别上具有很好的应用性,可以作为形态学分类系统的必要补充和佐证.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	毛勇	厦门大学海洋与地球学院近海海洋环境科学国家重点实验室	44	294	10.0	14.0
2	王军	厦门大学海洋与地球学院近海海洋环境科学国家重点实验室	144	2234	25.0	39.0
3	苏永全	厦门大学海洋与地球学院近海海洋环境科学国家重点实验室	145	2696	29.0	44.0
4	王攀攀	厦门大学海洋与地球学院近海海洋环境科学国家重点实验室	3	25	3.0	3.0
5	易啸	厦门大学海洋与地球学院近海海洋环境科学国家重点实验室	2	19	1.0	2.0