苦瓜MAP30基因启动子克隆与单倍型分析

• 作者: 刘子记 朱婕 杨衍 牛玉
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苦瓜 MAP30 启动子 单倍型
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 页码范围: 25-32
• 页数: 8页
• 分类号: Q78|S642.5
• 字数: 4125字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2018.01.005

摘要

为探明MAP30基因的表达调控规律,从苦瓜种质 Y5中克隆了 MAP30基因上游包括起始密码子在内1682 bp序列,选取转录起始位点上游1500 bp序列利用PlantCARE在线启动子预测工具进行分析,结果表明:MAP30启动子除了含有核心元件TATA-box和CAAT-box外,还含有大量的光响应元件、植物激素脱落酸响应元件、热胁迫响应元件、干旱应答元件、水杨酸应答元件等,该预测结果表明,MAP30启动子可能参与光、厌氧、逆境胁迫、脱落酸、水杨酸和乙烯等诱导,同时它还可能参与胚乳高效表达及昼夜节律调控.以30份苦瓜种质为材料,分析了MAP30启动子区域SNPs和InDels分布情况,共发现37个SNPs位点和6个InDels,SNPs分组发现,30份苦瓜种质资源MAP30基因启动子共存在3种单倍型,Y5、Y7、Y16、Y39、Y58、Y60、Y66、Y77、Y83、Y96、Y100、Y112、Y121属于第1组,Y43、Y50、Y90、Y108、Y113、Y115、Y140、Y141、Y144属于第2组,Y69、Y72、Y85、Y131、Y139、Y146、Y147、Y153属于第3组.结合顺式调控元件的位置,其中5个SNPs,342位点的T/C,584位点的A/G,783位点的G/T,872位点的A/G,1087位点的T/G,位于顺式调控元件内部,涉及的顺式调控元件分别为MBSI、ABRE、ARE、5UTR Py-rich stretch、GAG-motif、TC-rich repeats,SNP导致转录因子结合位点发生改变,可能对MAP30基因的表达调控有重要作用.为进一步揭示MAP30基因转录调控机制奠定理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨衍	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室	56	258	10.0	13.0
2	牛玉	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室	35	82	5.0	7.0
3	刘子记	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室	37	185	7.0	13.0
4	朱婕	海南大学热带农林学院	20	54	4.0	6.0