甘蓝型油菜矮化突变体的茎秆发育转录组分析

• 作者: 刘双双 牛显飞 王茂林 蒋学飞 解艳芳
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 甘蓝型油菜 矮化 茎秆伸长 转录组
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 201-206
• 页数: 6页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 3875字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0490-6756.2018.01.033

摘要

甘蓝型油菜矮化突变体"NDF-1"是从高秆油菜"3529"理化诱变群体中分离的矮化突变体,它的株高只有高秆亲本的1/3,是一个优良的甘蓝型油菜矮化资源.本文应用RNA-Seq测序技术分析了"NDF-1"茎开始伸长的抽薹期和花期转录组,为深入了解油菜茎秆发育机理提供基因组层面的参考.抽薹期和花期的测序数据通过筛选得到了4.55亿条质量合格的clean reads.经过对高质量序列的组装注释,筛选得到"NDF-1"和"3529"间的2147条差异表达基因(DEGs).选择其中的20个差异表达基因进行了荧光定量PCR验证.通过GO和KEGG分析,发现"NDF-1"的矮化与赤霉素 、生长素和油菜素内酯相关,细胞伸长异常和细胞壁的不正常形成也影响"NDF-1"的茎秆发育.从差异基因中筛选出与植物矮化性状相关的基因,为利用矮化基因改善性状和矮化机理的研究和提供了更多信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王茂林	四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室	80	590	14.0	21.0
2	刘双双	四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室	12	41	4.0	6.0
3	解艳芳	四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室	3	4	1.0	2.0
4	蒋学飞	四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室	4	5	1.0	2.0
5	牛显飞	四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室	3	6	2.0	2.0