黑果枸杞R1-MYB转录因子基因的克隆及表达分析

• 作者: 严莉 乔改霞 李健 王翠平 陈建伟
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 枸杞 R1-MYB转录因子 基因克隆 生物信息学 real-time PCR 表达分析
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 203-210
• 页数: 8页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2018.01.028

摘要

目的 对可能参与花青素代谢调控的黑果枸杞R1-MYB转录因子基因进行克隆、生物信息学分析和不同品种、同一品种不同器官及盐胁迫条件下差异表达分析.方法 通过同源基因克隆和RACE方法得到黑果枸杞R1-MYB转录因子编码区全长,通过转录组数据获得宁夏枸杞同源基因序列.通过Prot、Param、Smart、PSORT和SOPMA进行生物信息学分析,通过MEGA 5.0构建NJ系统进化树.同时采用Real-time PCR的方法进行基因表达分析.结果 获得黑果枸杞LrMYB lR1(KY568981)及宁夏枸杞LbMYB1 R1 (KY568982)基因全长cDNA,cDNA编码区全长1 496 bp,编码区为927 bp,编码产物包含308个氨基酸,编码蛋白相对分子质量分别为33 400和33 490,理论等电点分别为7.80和7.78,属于R1-MYB转录因子,经预测其编码蛋白位于细胞核中;LrMYB 1R1和LbMYB1R1与茄科植物番茄、马铃薯、烟草中的MYB 1R 1-like蛋白具有高度相似性.LrMYB1R1的表达表现出器官和发育阶段中差异性,具有品种特异性,LrMYB 1R1的表达受盐胁迫抑制.结论 丰富了对R1类MYB转录因子的研究,为接下来的基因功能研究及利用基因工程手段提高黑果枸杞中花青素含量奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	乔改霞	宁夏林业研究院种苗生物工程国家重点实验室	8	28	3.0	5.0
2	李健	宁夏林业研究院种苗生物工程国家重点实验室	18	158	7.0	12.0
3	王翠平	宁夏林业研究院种苗生物工程国家重点实验室	11	26	3.0	5.0
4	陈建伟	宁夏林业研究院种苗生物工程国家重点实验室	8	26	3.0	5.0
5	严莉	宁夏林业研究院种苗生物工程国家重点实验室	6	58	4.0	6.0