基于转录组测序的紫色秋葵花青素合成相关基因研究

• 作者: 余文权 应璐 张少平 张帅 洪建基 邱珊莲 郑开斌
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 紫色秋葵 花青素基因 转录组 测序分析 功能注释
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 474-480
• 页数: 7页
• 分类号: S661.2
• 字数: 3951字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.05.005

摘要

紫色秋葵富含花青素,因此其全株及果实均为紫红色,为获取正常生长状态下紫色秋葵花青素合成代谢相关基因,采用Illumina HiSeq 2500高通量转录组测序技术对紫色秋葵全转录功能基因组测序后组装,再通过Nr 、 SwissProt和GO 等三大数据库进行花青素相关功能基因筛选.三大数据库涉及 35 个花青素相关Unigene ,具体包括19个花青素相关糖基转移酶、 6个花青素酰基转移酶家族基因,5个无色花色素双加氧酶(合酶)以及5个花色素相关还原酶.这些花青素相关基因在Nr及SwissProt数据库中涉及较多相关植物,包括拟南芥、可可、树棉、木薯、苹果及葡萄等.聚类分析研究表明:涉及花青素相关四大家族成员的 35 个Unigene中,无色花色素双加氧酶亲缘关系最近,花青素酰基转移酶次之,花青素相关还原酶亲缘关系稍远,而花青素相关糖基转移酶家族成员亲缘关系最远.本研究获取的紫色秋葵众多花青素相关转移酶、合酶及还原酶等相关Unigene ,为进一步研究紫色秋葵或其他植物的花青素合成代谢过程中基因克隆分析等奠定了坚实基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑开斌	福建省农业科学院亚热带农业研究所	125	346	9.0	12.0
2	余文权		50	161	7.0	10.0
3	洪建基	福建省农业科学院亚热带农业研究所	96	314	10.0	13.0
4	张少平	福建省农业科学院亚热带农业研究所	91	247	8.0	10.0
5	邱珊莲	福建省农业科学院亚热带农业研究所	69	275	9.0	14.0
6	张帅	福建省农业科学院亚热带农业研究所	51	103	6.0	8.0
7	应璐		11	13	3.0	3.0