蓖麻RcDELLA基因的克隆及序列分析

• 作者: 丛安琪 李国瑞 李威 李孟建 李晓晨 白英俊 陈永胜 黄凤兰
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 蓖麻 DELLA 序列分析 系统进化
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 页码范围: 14-19
• 页数: 6页
• 分类号: S565.03|Q78
• 字数: 3578字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2018.01.003

摘要

DELLA家族蛋白是植物GA信号途径的重要阻遏蛋白,能抑制植物的生长和发育,使植株产生矮化的表型.为了明确DELLA基因在蓖麻中的作用和功能,对RcDELLA基因进行生物学信息分析.以蓖麻2129六叶期茎尖的cDNA为模板,根据NCBI公布的DELLA(XM 002533984.2)蛋白基因片段设计引物,克隆该基因,并对其进行生物信息学分析.克隆得到该基因的完整阅读框,该基因编码序列全长为1701 bp,编码567个氨基酸,推测其分子量为62550.40 ku,等电点为5.14.二级结构预测表明α-螺旋占40.4%,β-折叠占8.6%,无规则卷曲占51.0%.系统进化树结果表明,RcDELLA先与大戟科巴西橡胶树和麻疯树形成分支.通过PCR扩增得到了RcDELLA基因的完整阅读框,同源性比对结果显示,RcDELLA具有典型的DELLA结构域,与NCBI上公布的其他植物的DELLA蛋白序列具有高度的同源性.系统进化树结果显示,与麻疯树亲缘关系最近,符合进化关系.生物信息学分析将为进一步研究DELLA基因在蓖麻矮化过程中的作用和功能奠定理论基础.