花生PDAT基因家族的全基因组生物信息学分析

• 作者: 万书波 单雷 孟静静 张智猛 彭振英 李新国 田海莹 郭峰
• 来源期刊: 花生学报
• 学科: 农学
• 关键词: 花生 二酰甘油酰基转移酶 进化 表达模式 可变剪接
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告与简报
• 页码范围: 1-7,13
• 页数: 8页
• 分类号: S565.2|Q811.4
• 字数: 5311字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14001/j.issn.1002-4093.2018.03.001

摘要

磷脂二酰甘油酰基转移酶(phospholipids:diacylglycerol acyltransferase,PDAT)催化磷脂和二酰甘油反应,生成溶血磷脂和三酰甘油,是植物三酰甘油合成的关键酶之一.为了在全基因组水平上探究花生PDA T(AhPDA T)基因家族的特征,通过生物信息学方法,结合花生基因组和转录组数据对AhPDAT家族成员从系统进化、基因结构、表达模式以及可变剪接等方面进行系统分析.结果显示,AhPDAT家族包含17个成员,不均匀分布于9条染色体上.系统进化分析发现,AhPDATs与大豆、苜蓿以及菜豆聚在一起,亲缘关系较近.基因结构分析显示,AhPDATs基因具有2～8个外显子,可编码88～742个氨基酸.表达模式分析发现,AhPDATs家族成员组织表达多样化,这种表达模式的差异表明它们功能分工的不同.同时,该家族基因还存在丰富的可变剪接类型.这些结果为今后进一步开展AhPDATs基因家族的功能研究提供参考,同时也为花生品质育种奠定了一定的理论基础.