内禀无序蛋白构象与带电氨基酸残基排布关系——以精氨酸和天冬氨酸组成的随机多肽为例

• 作者: 康文斌 王炜 王骏
• 来源期刊: 物理学报
• 关键词: 内禀无序蛋白 构象 序列 分子模拟
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 物理学交叉学科及有关科学技术领域
• 页码范围: 292-300
• 页数: 9页
• 字数: 4949字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7498/aps.67.20172246

摘要

内禀无序蛋白的结构特征与其氨基酸序列有着密切的联系.其中一个核心问题是正负带电氨基酸残基的排列如何影响无序蛋白或者多肽的构象?为了回答这一问题,本研究以天冬氨酸和精氨酸两种带电残基组成的随机多肽为研究对象,利用全原子蒙特卡罗模拟和温度副本交换采样方法,研究了随机多肽的电荷排布与结构之间的定性关系.结果表明:正负带电残基在序列上混合均匀时,由于肽链内部的静电吸引和排斥相互抵消,肽链倾向于形成无规卷曲的构象;正负带电残基分离时,由于长程静电相互吸引,多肽倾向于形成类β-发卡的形状.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王炜	南京大学物理学院	54	286	9.0	14.0
2	王骏	南京大学物理学院	14	120	4.0	10.0