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玉米子粒脂肪含量的全基因组关联分析
玉米子粒脂肪含量的全基因组关联分析
作者:
代力强
吴律
施婷婷
王丕武
董青松
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
玉米
脂肪
全基因组重测序
全基因组关联分析
候选基因
摘要:
利用分子标记对控制玉米脂肪合成的关键基因进行定位,从分子水平上阐明其遗传机理,提高高油玉米的育种效率.以吉林省80份核心玉米自交系为关联群体,2014年和2015年分别在吉林农业大学试验地进行田间试验,将自交收获的果穗晾晒脱粒后用NIRFlex N-500近红外光谱仪测定其子粒脂肪含量.同时使用Illumina PE150测序仪对80份玉米自交系进行全基因组重测序,共获得1490007个高质量的SNP用于后续的关联分析.结果表明,玉米子粒脂肪含量的变异范围为2.83%~ 6.81%,广义遗传力为63.3%.经过两年1点的全基因组关联分析共筛选得到10个SNP位点与子粒的脂肪含量显著关联(P<0.000 001),解释的表型贡献率为0.65%~34.5%,其中位于染色体框4.01的SNP标记表型贡献率最高为34.5%.在显著性SNP位点(P<0.000 001)的连锁不平衡区域(5.2 kb)内共挖掘出6个候选基因,分别预测编码MYB转录因子、果胶酯酶、谷氨酰胺合成酶和3种无特征功能的假定蛋白,可能与脂肪的合成代谢密切相关,可为高油玉米材料的分子标记辅助选择及克隆调控玉米子粒脂肪含量的关键基因提供参考.
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篇名
玉米子粒脂肪含量的全基因组关联分析
来源期刊
玉米科学
学科
农学
关键词
玉米
脂肪
全基因组重测序
全基因组关联分析
候选基因
年,卷(期)
2018,(2)
所属期刊栏目
遗传育种·品种资源
研究方向
页码范围
58-63
页数
6页
分类号
S513.033
字数
语种
中文
DOI
10.13597/j.cnki.maize.science.20180209
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
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王丕武
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研究去脉
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期刊影响力
玉米科学
主办单位:
吉林省农业科学院
国家玉米工程技术研究中心(吉林)
国家玉米改良中心
中国农业科技东北创新中心
出版周期:
双月刊
ISSN:
1005-0906
CN:
22-1201/S
开本:
大16开
出版地:
吉林省长春市净月开发区彩宇大街1363号
邮发代号:
12-137
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
4142
总下载数(次)
5
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