丹参Pht1基因家族的挖掘、鉴定及其特征性分析

• 作者: 严铸云 孙莹 王清蓉 穆帝秀 陈新
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 丹参 Pht1基因家族 特征分析 功能预测 诱导表达
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 194-202
• 页数: 9页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2018.01.027

摘要

目的 对丹参Salvia miltiorrhiza基因组中存在的Pht1基因家族成员进行挖掘、鉴定和功能预测分析,为进一步研究和利用Pht1这一功能基因家族奠定基础.方法 基于丹参基因组数据库及NCBI数据库,借助生物信息学方法,首先筛选获得丹参Pht1家族候选基因的序列,进而对其进行多重序列比对、保守结构查找及系统进化树构建,最后完成其特征性分析和生物学功能预测.结果 从丹参基因组中共挖掘出了12个新的Pht1候选基因,加上已报道的Smpht1,共13个Pht1成员,其同源性高达74.34％,并对9个成员提供了比较可靠的功能注释.该家族基因中,Smpht1&Sm1、Sm4&Sm6、Sm5&Sm11这3对成员可能属于彼此协同进化的同功能基因;Smpht1、Sm1、Sm3、Sm5、Sm7及Sm11这6个成员在丹参根部表达,除了受缺磷特异性诱导表达的Sm7和不受磷素供缺因素所影响的Sm3以外,其余4个均有可能属于缺磷诱导增强表达型基因,进而对丹参磷素吸收起着重要作用;另外,Sm7与Sm16还有可能在丹参花器官中表达而参与植株花期磷素平衡的调节;Sm14则很有可能是一个菌根诱导特异性表达的磷转运基因.结论 首次系统地从丹参基因组中挖掘筛选出Pht1基因家族,并发现了具有特征性生物学功能的成员,这将为进一步阐明Pht1在丹参生长发育和药效成分代谢中所起作用的相关研究提供背景支持和思路参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	严铸云	成都中医药大学药学院	78	692	14.0	21.0
2	陈新	成都中医药大学药学院	41	425	12.0	19.0
3	王清蓉	成都中医药大学药学院	5	5	1.0	2.0
4	穆帝秀	成都中医药大学药学院	4	5	1.0	2.0
5	孙莹	成都中医药大学药学院	4	5	1.0	2.0