稻曲病菌基因组DNA提取方法比较与小文库构建

• 作者: 伏荣桃 卢代华 王剑 罗曦 郑爱萍 陈诚 龚学书
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 稻曲病菌 CTAB SDS 基因组小文库
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 102-106
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017-0686

摘要

水稻稻曲病是由稻曲病菌引起的真菌病害,现已成为水稻重要的病害之一.旨在寻找一种最佳的稻曲病菌基因组DNA提取方法,并构建基因组小文库.采用CTAB、SDS和真菌DNA试剂盒3种提取方法提取稻曲病菌基因组DNA,并用Illumina系统测序分析,构建基因组小文库.结果显示,CTAB提取法能得到高质量的基因组DNA,小文库测序组装共得29350288碱基(bp)和17908 Scaffold,总碱基的GC含量为49.79％.CTAB提取法是稻曲病菌基因组DNA最佳的提取方法,基因组小文库成功的构建为稻曲病菌的基因组gap的填补和致病相关基因的鉴定提供了数据资源.