利用核心SNP标记划分辽宁省常用玉米自交系杂种优势群的研究

• 作者: 姜思奇 崔震海 张敖 时免免 赵艳贺 邓丽霞 郭瑞 阮燕晔
• 来源期刊: 玉米科学
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 单核苷酸多态性 杂种优势群 遗传相似度 聚类分析
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·品种资源
• 页码范围: 17-23
• 页数: 7页
• 分类号: S513.035.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13597/j.cnki.maize.science.20180403

摘要

利用3个密度的SNP标记对44份玉米自交系进行杂种优势群划分, 包括8份对照自交系和36份辽宁省常用育种自交系.利用56k玉米芯片共筛选得到了46 899个高质量的SNP标记, 作为高密度SNP标记划分杂种优势群, 然后筛选1 008、101个SNP标记分别作为中密度和低密度SNP标记用于分群.结果表明, 部分自交系的遗传相似度达到90％以上, 不宜作为不同自交系进行育种应用.3个密度下的SNP标记都有效地将待测玉米自交系划分为4个杂种优势群, 分别为瑞德群、兰卡斯特群、旅大红骨与塘四平头混合群以及类PH4CV群.对比高密度SNP标记, 利用中低密度SNP标记划分的杂种优势群内部分自交系间的遗传距离发生变化, 不能精确解析杂种优势群群内自交系的亲缘关系.划分杂种优势群可以采用中低密度的SNP育种芯片;群内自交系亲缘关系的区分应该采用高密度SNP芯片.