菜用大豆蔗糖转运蛋白生物信息学分析

• 作者: 张玉梅 林国强 胡润芳
• 来源期刊: 大豆科学
• 关键词: 菜用大豆 蔗糖转运蛋白 生物信息学分析 GmSUT基因
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 866-870
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2018.06.0866

摘要

为揭示菜用大豆SUT基因的结构特点,并为提高其表达活性提供理论依据,利用RT-PCR技术克隆菜用大豆SUT基因,长度为1 634 bp,编码区1 566 bp,编码一个含有521个氨基酸残基的多肽.生物信息学分析表明,SUT理论等电点9.33,理论分子量55.19 kD,是疏水性蛋白.SOMPA分析表明,SUT各个氨基酸残基对应的二级结构为α螺旋45.11％、β折叠14.20％、无规则卷曲36.47％和β转角4.22％;氨基酸序列和结构分析显示SUT蛋白包含1个保守区,即MFS2 domain和12个跨膜区.SignalP分析表明该蛋白没有信号肽.系统进化树分析表明菜用大豆GmSUT蛋白与绿豆(Vignaradiata var.radiata)的亲缘关系最近,同源性达93.28％.将该蛋白与拟南芥的9个SUC蛋白比对表明GmSUT与AtSUC2的亲缘关系最近,属于SUT1亚族.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡润芳	福建省农业科学院作物研究所	52	235	8.0	12.0
2	张玉梅	福建省农业科学院作物研究所	20	66	4.0	7.0
3	林国强	福建省农业科学院作物研究所	49	223	8.0	12.0