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基于16S rRNA和COI基因序列的柔鱼亚科系统进化关系探讨
基于16S rRNA和COI基因序列的柔鱼亚科系统进化关系探讨
作者:
任桂静
唐峰华
张凤英
马凌波
马春艳
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
柔鱼亚科
线粒体DNA
贝叶斯分析
系统进化关系
摘要:
测定了柔鱼亚科(Ommastrephinae)中的柔鱼(Ommastrephes bartramii)、茎柔鱼(Dosidicus gigas)、鸢乌贼(Sthenoteuthis oualaniensis)、发光柔鱼(Eucleoteuthis luminosa)的线粒体COI和16S rRNA基因的部分序列,结合从GenBank中获得的玻璃乌贼(Hyaloteuthis pelagica)、鸟柔鱼(Ornithoteuthis volatilis)、大西洋鸟柔鱼(Ornithoteuthis antillarum)的同源序列,以太平洋褶柔鱼(Todarodes pacificus)、阿根廷滑柔鱼(Illex argentinus)为外群,运用贝叶斯法(BI)构建了分子系统树,同时联合了2个基因片段序列,运用贝叶斯联合模型综合探讨了柔鱼亚科种类的系统发育关系.研究发现,除16S rRNA基因外,COI基因片段和联合模型所构建的系统树拓扑结构完全一致;结合形态学资料,发现玻璃乌贼、发光乌贼和鸢柔鱼亲缘关系较近,且形态上都出现了外套膜大型发光器,是柔鱼亚科中分化较晚的种类;其次茎柔鱼、柔鱼与其它种类存在较大的遗传距离,形态上丢失了内脏和眼球发光器,可能预示着柔鱼亚科种类一个新的进化方向;鸟柔鱼属两个种为柔鱼亚科中最原始种类,且为褶柔鱼亚科向柔鱼亚科进化过程中的过渡物种.
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PCR
16S rRNA
分子演化
起始密码下游序列与16s rRNA 3′端序列的匹配性对基因表达效率的影响
目的基因
16s rRNA
序列匹配性
基因表达
内容分析
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相关文献总数
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文献信息
篇名
基于16S rRNA和COI基因序列的柔鱼亚科系统进化关系探讨
来源期刊
海洋渔业
学科
物理学
关键词
柔鱼亚科
线粒体DNA
贝叶斯分析
系统进化关系
年,卷(期)
2018,(5)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
522-530
页数
9页
分类号
O349
字数
5070字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1004-2490.2018.05.002
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
唐峰华
中国水产科学研究院东海水产研究所农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室
29
303
11.0
17.0
2
张凤英
中国水产科学研究院东海水产研究所农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室
25
488
13.0
22.0
3
马春艳
中国水产科学研究院东海水产研究所农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室
16
325
9.0
16.0
4
任桂静
中国水产科学研究院东海水产研究所农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室
1
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研究去脉
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海洋渔业
主办单位:
中国水产学会
中国水产科学研究院东海水产研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1004-2490
CN:
31-1341/S
开本:
大16开
出版地:
上海市军工路300号
邮发代号:
4-630
创刊时间:
1979
语种:
chi
出版文献量(篇)
1513
总下载数(次)
2
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