赤桉抗风和生长性状的SSR关联分析

• 作者: 吴志华 尚秀华 张沛健 李超 罗建中 谢耀坚
• 来源期刊: 南京林业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 赤桉 抗风性状 群体结构 关联分析 等位变异
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 97-105
• 页数: 9页
• 分类号: S722.3+6
• 字数: 6864字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.201711019

摘要

[目的]为了解赤桉抗风性和寻找与赤桉抗风相关联的分子标记,对影响桉树抗风性状的有利等位变异及携带优异等位变异的载体材料进行了分析,为桉树抗风分子育种奠定基础.[方法]以109份赤桉栽培种组成的半同胞群体为材料,利用关联分析方法对多态性高的107对SSR引物进行基因型检测,利用Structure2.3.4软件对供试材料进行群体结构和连锁不平衡分析的基础上,采用TASSEL 3.0软件的混合模型MLM程序,对与赤桉抗风有关的树高、胸径、材积、风害指数4个性状进行关联分析,根据计算的表型效应值,鉴别和统计优异的等位位点.[结果]通过群体遗传结构分析将109份赤桉材料分为2个亚群.通过关联分析,获得与抗风性状相关联的等位变异位点25个(P<0.05),生长及抗风性状表型变异的解释率为9.26％～71.14％,平均解释率为36.27％.其中与树高性状相关标记最多,为13个,贡献率最高的是EUCeSSR235(71.14％),增加树高表型效应最大的等位变异是EUCeSSR352-320,载体品种有9个;与胸径显著相关的标记有7个,贡献率最高的是EUCeSSR332(63.29％),EUCeSSR489-128是增加表型效应最大等位变异,载体品种有11个;与材积显著相关的标记有5个,贡献率最高的标记是EUCeSSR332(61.38％),增加表型效应最大的等位变异是EUCeSSR489-128,载体品种有11个;与风害指数显著相关的标记有10个,贡献率最高的是EUCeSSR235(71.14％),减少表型效应最大的等位变异是EUCeSSR875-90,载体品种有34个.同时检测到7个标记与2个以上性状相关联,标记EUCeSSR332与树高、胸径、材积、风害指数等4个性状均同时关联,该标记对4个性状表型变异解释率超过60％.标记EUC-eSSR484、EUCeSSR352、EUCeSSR570和EUCeSSR422与树高和风害指数2个性状均关联,EUCeSSR489和EUC-eSSR114标记与树高和材积2个性状关联.[结论]109份赤桉供试材料的群体遗传结构简单,连锁不平衡水平低.基于SSR的关联分析,发掘了与赤桉抗风性状相关的优异等位变异基因,可用于桉树抗风性状分子标记辅助育种.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗建中	国家林业局桉树研究开发中心	55	471	13.0	18.0
2	谢耀坚	国家林业局桉树研究开发中心	130	1807	22.0	36.0
3	吴志华	国家林业局桉树研究开发中心	96	1132	18.0	30.0
4	尚秀华	国家林业局桉树研究开发中心	45	275	10.0	14.0
5	张沛健	国家林业局桉树研究开发中心	37	158	8.0	10.0
6	李超	国家林业局桉树研究开发中心	12	44	4.0	6.0