玉米叶夹角的全基因组关联分析

• 作者: 孙娇 宋希云 潘顺祥 裴玉贺 赵美爱 郭新梅
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 叶夹角 相关性分析 关联分析
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 页码范围: 60-64
• 页数: 5页
• 分类号: S513.03|Q78
• 字数: 2194字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2018.01.010

摘要

为了阐述玉米叶夹角的遗传基础并定位相关的数量性状位点,利用289份常用玉米自交系为试验材料,在自然条件下测量玉米穗上叶夹角,对其进行性状分析,结果表明,各个环境的穗上叶夹角数据呈正态分布,并且各个环境间的数据呈极显著正相关.同时采用MaizeSNP50基因芯片进行基因分型,利用R平台下的farmCPU对叶夹角进行全基因组关联分析.在4个环境中共检测到42个与玉米叶夹角显著关联(P< 0.00001)的SNP,其中1,5,8号染色体在4个环境下都检测到与穗上叶夹角紧密关联的SNP标记.对筛选出的所有标记综合分析,共鉴定出15个与玉米叶夹角相关的SNP标记位点,分布在Bin1.02、Bin1.03、Bin1.06、Bin1.11、Bin2.05、Bin3.04、Bin5.03、Bin5.04、Bin8.03、Bin8.04、Bin10.07处.采用全基因组关联分析的方法发掘叶夹角基因位点及候选基因,对揭示玉米叶夹角的遗传机理,加速玉米育种进程具有重要的意义.