美味猕猴桃过氧化物酶基因AdPOD27的密码子偏好特征分析

• 作者: 冯新 吴如健 胡艺贤 赖瑞联 钟春水 陈义挺 高敏霞
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 美味猕猴桃 过氧化物酶 密码子偏好性 聚类分析
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 1344-1350
• 页数: 7页
• 分类号: S663.4
• 字数: 3736字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2018.07.013

摘要

为了解美味猕猴桃过氧化物酶基因AdPOD27的密码子偏好特征,本研究采用CodonW1.4.2、SPSS19.0、MEGA5.2和EMBOSS等软件分析AdPOD27的密码子偏好性参数,同时对单子叶植物和双子叶植物间POD27的密码子使用规律进行比较.结果表明,AdPOD27有效密码子数(ENc)、密码子G和C含量(GC)、密码子第3位G或C的含量(GC3s)分别为50.65、0.443和0.429,意示着AdPOD27密码子偏好性较弱但偏好使用含有较多A和T并以A或T结尾的密码子;单子叶植物和双子叶植物平均ENc值分别为36.93和52.25,单子叶植物POD27密码子偏好性普遍强于双子叶植物;聚类分析结果表明,物种间具有严格的密码子偏好性规律.此外,AdPOD27与猕猴桃基因组密码子使用频率存在一定差异.本研究结果为进一步开展AdPOD27基因功能和分子进化研究提供了科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈义挺	福建农业科学院果树研究所	2	22	1.0	2.0
2	赖瑞联	福建农业科学院果树研究所	1	1	1.0	1.0
3	冯新	福建农业科学院果树研究所	1	1	1.0	1.0
4	高敏霞	福建农业科学院果树研究所	1	1	1.0	1.0
5	钟春水	福建农业科学院果树研究所	1	1	1.0	1.0
6	胡艺贤	福建农业科学院果树研究所	1	1	1.0	1.0
7	吴如健	福建农业科学院果树研究所	1	1	1.0	1.0