浅蛤属(Mαcridiscus)包括3个形态非常相似的物种,即黑浅蛤(M. melanaegis)、等边浅蛤(M. multifarius)和半步目浅蛤(M.semicancellta),其中前二者为同域分布.根据形态学特征,浅蛤属物种较难区分.本研究以改进的 CTAB法提取浅蛤个体基因组DNA后,用引物Macr_C01_F16834和Cytb_Macr_R2 PCR配对进行聚合酶链式反应 (PCR),扩增线粒体DNA控制区至细胞色素b基因(Cyt b)的DNA片段并进行序列测定,结果发现在黑浅蛤控制区偏3'端,存在该种特有的长度为363 bp的数目可变串联重复序列(variable number of tandem repeat, VNTR),种内因该 VNTR出现1~3次不等的串联拷贝,而表现出广泛的长度多态性和个体内线粒体异质性现象,这是目前在动物线粒体控制区中发现的最大的VNTR;在半步目浅蛤的控制区的偏3'端,则同时存在14和17 bp的2个较短的VNTRs,该物种也因这2个VNTRS的拷贝数目不同,而存在广泛的长度多态性;而等边浅蛤的该段序列长度保守,没有与其他物种共享的VNTR.以该段序列作为分子标记,运用PCR技术能够快速准确地识别浅蛤属物种.