基于线粒体COI基因序列的磷虾目分子系统进化

• 作者: 冯春雷 王伟 王鲁民 谌微 马凌波 马春艳
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 磷虾目 线粒体DNA COI 分子系统进化
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 867-879
• 页数: 13页
• 分类号: S931
• 字数: 6384字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2018.18051

摘要

为探讨磷虾目物种的系统进化关系,以磷虾目的 50种磷虾为研究对象,分析其线粒体COI基因序列的分子变异,构建系统发育树,初步探讨了磷虾种属间亲缘关系.所分析COI基因可比序列长度为519 bp,共包含258个变异位点,全部为碱基替换,无插入/缺失位点.四种碱基含量分别为A 27.58％、T 35.47％、G 18.88％、C 18.07％,碱基A+T含量(63.05％)显著高于G+C含量(36.95％),表现出明显的T偏倚特点.50种磷虾的种间遗传距离为0.065～0.306,其平均值为0.186;而种内遗传距离为0～0.071,其平均值为0.017,平均种间距离约为种内距离的11倍.根据物种鉴定最小种间遗传距离0.020的观点,COI基因序列间的差异能够很好地区分各磷虾种.基于COI基因分别构建了4种系统进化树:邻接树(neighbor-joining,NJ)、极大似然树(maximum likelihood,ML)、最大简约树(maximum parsimony,MP)及UPGMA(unweighted pair-group method with arithmetic means)树.它们拓扑结构基本一致,均可分为三大支系:假磷虾属处于系统树的基部,是磷虾目中最早分化出来的一支;而包含磷虾种类最多的磷虾属则最后分化出来,表明其为磷虾类中相对较新的一个属.本研究较全面地阐述了磷虾目的系统进化关系,结果表明磷虾目的线粒体COI序列变异可以用来研究磷虾属、种的分类单元及其系统进化问题,具有较好的理论和应用价值.