梨小食心虫幼虫中肠转录组及SSR分子标记分析

• 作者: 仵均祥 冷春蒙 李引 李怡萍 胡迪
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 梨小食心虫 中肠 转录组 SSR 分子标记 Illumina HiSeq
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 1272-1283
• 页数: 12页
• 分类号: Q966
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2018.11.004

摘要

[目的]梨小食心虫Grapholitha molesta是一种重要的世界性果树害虫.昆虫中肠在食物消化、免疫反应、生长发育等方面发挥着重要作用.本研究旨在建立梨小食心虫幼虫中肠转录组数据库,挖掘其基因信息.[方法]利用高通量测序平台(Illumina HiSeq X Ten)对梨小食心虫幼虫中肠进行转录组测序、组装及生物信息学分析;进而利用转录组数据进行梨小食心虫幼虫中肠SSR分子标记鉴定.[结果]总计获得梨小食心虫幼虫中肠转录组96 419条unigenes,与公共数据库比对,共注释到57 300条unigenes.通过GO数据库注释,将unigenes的功能分为生物学进程、细胞组分和分子功能三大类55个功能区,其中参与细胞进程、细胞和细胞组分及结合功能的unigenes比例较大.KOG结果显示,10 090条unigenes归到25个基因家族,注释到一般功能预测的最多.KEGG数据库中,10 250条序列注释到232个代谢通路,注释到核糖体的基因数最多.此外,用MISH软件,在10 600条unigenes中搜索到12 690个SSR位点,通过PCR开发出6个SSR位点.[结论]本研究成功组装梨小食心虫幼虫中肠参考转录组,为以中肠为靶标的害虫防治提供理论依据.