黑线仓鼠Htr1a克隆及生物信息学分析

• 作者: 吴明 徐来祥 徐金会 薛慧良 高桂彬
• 来源期刊: 曲阜师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 黑线仓鼠 Htr1a 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 73-80
• 页数: 8页
• 分类号: Q785
• 字数: 4940字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-5337.2018.4.073

摘要

Htr1a是介导5-HT系统功能的关键,主要分布于额叶皮层、海马、外侧隔、中缝背核、脊髓前角等.该研究以黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)为实验材料,用RT-PCR技术克隆黑线仓鼠Htr1a的部分cD-NA序列1486 bp(GeneBank登录号:MH169583),运用生物信息学对Htr1a核酸序列以及蛋白质序列进行分析,构建系统进化树.研究结果表明:克隆的Htr1a部分cDNA序列包含一个完整的开放阅读框1269 bp,部分5',非翻译区和部分3',非翻译区,共编码422个氨基酸.Htr1a蛋白质分子量为46332.47 Da,等电点为9.18,该蛋白质有7个跨膜螺旋,一个G蛋白偶联受体家族标签,不含有信号肽,不属于分泌蛋白,疏水性分析也表明其符合膜蛋白的特征;同源性比对和系统进化树分析显示,黑线仓鼠与中国仓鼠(Cricetulus griseus)亲缘关系相近,与啮齿类较近,而与其他哺乳类和鸟类物种的亲缘关系均较远,这与传统的物种分类相一致.以上结果证实本实验成功克隆到黑线仓鼠Htr1a的部分cDNA序列,为进一步探究黑线仓鼠5-HT系统功能奠定了分子生物学基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐来祥	曲阜师范大学生命科学学院	95	654	12.0	22.0
2	薛慧良	曲阜师范大学生命科学学院	51	182	8.0	11.0
3	徐金会	曲阜师范大学生命科学学院	40	116	7.0	9.0
4	吴明	曲阜师范大学生命科学学院	8	0	0.0	0.0
5	高桂彬	曲阜师范大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0