基于线粒体COI序列的DNA条形码在中国海口足类物种鉴定中的应用分析

• 作者: 沙忠利 王永良 程娇
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 口足类 COI基因 DNA条形码 物种鉴定 隐存种
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 858-866
• 页数: 9页
• 分类号: S917
• 字数: 5676字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2018.17338

摘要

中国海口足类动物区系具有丰富的物种多样性,是我国海洋底栖生物中的重要经济类群.口足类的属内种间鉴别特征有的极为相似,仅依靠传统的形态分类方法很难对近缘种和疑难种进行准确的鉴定.DNA条形码技术可以弥补传统形态学鉴定的某些局限,为物种鉴定提供了有效的工具.该研究探讨了利用线粒体COI序列对中国海口足类进行物种鉴定的可行性,共获得口足目4总科6科24属38个种的204条线粒体COI序列,与GenBank收录的14种42条口足类同源序列进行比对,结果显示口足类COI基因不存在碱基插入缺失现象,碱基组成偏倚明显,A+T含量(63.5％)显著高于G+C含量(36.5％).基于Kimura双参数模型计算遗传距离,结果显示遗传距离随着分类阶元的增高而增大.同物种种内个体间的遗传距离变化范围在0％～3.91％,平均值为0.76％.同属内各物种间的遗传距离变化范围为6.55％～18.99％,平均值为12.91％.同科内不同属间的遗传距离变化范围为9.16％～23.32％,平均值为16.89％.不同科间的遗传距离变化范围为16.52％～26.6％,平均值为21.31％.由此可见,口足类COI基因的种间和种内遗传距离存在明显的间隙.基于COI序列构建的口足类邻接关系树显示所有包含大于1个个体的物种均可形成单系群,且节点支持率均为100％.本研究证明了COI序列作为DNA条形码标准基因在口足类物种鉴定中的有效性.此外,研究发现中国沿海分布的口虾蛄可能至少存在两个隐存种,实证了基于COI序列的DNA条形码技术能够用于口虾蛄隐存多样性的探究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沙忠利	中国科学院海洋研究所	9	18	2.0	3.0
10	王永良	中国科学院海洋研究所	15	35	3.0	5.0
11	程娇	中国科学院海洋研究所	1	2	1.0	1.0