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基于ITS2序列多种龙胆属植物及药材的DNA条形码鉴定研究
基于ITS2序列多种龙胆属植物及药材的DNA条形码鉴定研究
作者:
康廷国
王孟虎
石达理
许亮
陈思有
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
DNA条形码
ITS2
龙胆
聚类分析
二级结构
摘要:
目的:基于内转录间隔区2(internal transcribed spacer2,ITS2)碱基序列,运用DNA条形码方法对龙胆属多种植物及药材进行鉴别分类研究,为龙胆药材和基原植物的鉴定和遗传多样性研究提供科学的理论依据.方法:利用试剂盒提取法,提取药材及原植物叶片的DNA,对其中特定的ITS2序列进行PCR扩增及测序,并从Gen-Bank下载同科属植物序列,运用SeqMan软件对序列进行拼接去引物处理之后,采用MEGA 6.0软件对数据进行分析比对,计算K2P遗传距离,并建立Neighbor-Joining(NJ)树,结合下载的序列二级结构,进行比对,分析差异.结果:从NJ聚类树可以看出,不同品种的龙胆属植物三花龙胆、深红龙胆、坚龙胆和笔龙胆都各聚为一支,区分明显,龙胆与条叶龙胆聚为一支未能区分开.除去笔龙胆1份样品产生种内变异之外,各同品种样品的ITS2序列均一致相同,并能与外族群品种准确区分开.结论:运用ITS2序列对龙胆药材及基原植物进行鉴别是有效可行且成功率高的一种方法,能对不同品种、近缘品种进行鉴别,有较强的可行性,DNA分子条形码鉴别方法可用于龙胆属不同植物及药材的鉴定分类.
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文献信息
篇名
基于ITS2序列多种龙胆属植物及药材的DNA条形码鉴定研究
来源期刊
中药材
学科
医学
关键词
DNA条形码
ITS2
龙胆
聚类分析
二级结构
年,卷(期)
2018,(1)
所属期刊栏目
资源与鉴别
研究方向
页码范围
79-83
页数
5页
分类号
R282.5
字数
语种
中文
DOI
10.13863/j.issn1001-4454.2018.01.016
五维指标
作者信息
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姓名
单位
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1
许亮
142
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11.0
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康廷国
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石达理
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ITS2
龙胆
聚类分析
二级结构
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中药材
主办单位:
国家食品药品监督管理局
中药材信息中心站
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-4454
CN:
44-1286/R
开本:
大16开
出版地:
广州市中山二路24号中粤大厦10楼
邮发代号:
创刊时间:
1978
语种:
chi
出版文献量(篇)
11967
总下载数(次)
20
总被引数(次)
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