茶树PPO基因家族的鉴定与分析

• 作者: 曾泽媛 李勤 李娟 林海燕 王坤波 罗勇 郑楚楚
• 来源期刊: 茶叶科学
• 学科: 工学
• 关键词: 茶树 多酚氧化酶 基因家族 序列分析
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 页码范围: 385-395
• 页数: 11页
• 分类号: TS272.2|Q52
• 字数: 5908字
• 语种: 中文

摘要

多酚氧化酶(Polyphenol oxidases,PPO)是由核酸编码的一种以氧为受体的含铜金属酶,为一种末端氧化酶,在茶叶加工中也发挥重要的作用.从最新发布的茶树基因组数据库中获得了5条PPO基因:CsPPO1、CsPPO2、CsPPO3、CsPPO4(GenBank登录号为GQ129142.1)、CsPPO5.本研究利用生物信息学方法,对5条基因的核酸序列和氨基酸序列进行分析,并对基因编码蛋白的理化性质和结构功能进行预测.结果表明,5个基因CDS区全长在597～1839 bp之间,编码氨基酸数目198～612;系统进化树分析显示CsPPO1、CsPPO3、CsPPO4和CsPPO5具有较近的亲缘关系;编码的蛋白均属于亲水性不稳定类脂类结合蛋白,都不具有信号肽;无规则卷曲是蛋白质的主要结构元件,α-螺旋和 β-折叠分散于整个多肽链中,CsPPO1、CsPPO2、CsPPO3可能存在一个或多个跨膜螺旋;5个蛋白均含有PPO1_DWL(pfam12142)保守结构域,除了CsPPO2外,其余4个蛋白均预测到TYROSINASE功能结构域.实时定量PCR结果表明,PPOs基因在不同茶树品种间呈现出不同的表达模式.