PEG模拟干旱胁迫下野生大豆转录组分析

• 作者: 乔亚科 张小芳 张炜坤 张锴 徐燕 李桂兰 王冰冰 赵恢
• 来源期刊: 大豆科学
• 关键词: 野生大豆 RNA-seq 干旱胁迫 转录组
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 681-689
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2018.05.0681

摘要

为研究耐旱型野生大豆在干旱胁迫下基因表达谱的变化,从备选野生大豆材料中筛选抗旱性强的野生大豆品种,同时探讨最适PEG胁迫浓度,而后以野生大豆永46为试验材料,利用RNA-seq技术对20％ PEG6000处理不同时间的叶片进行基因表达谱差异分析.结果显示:获得39 183个序列信息,其中各时期共有序列27 875个.随干旱胁迫时间延长,差异表达基因数量发生变化,胁迫12 h达到最多.根据GO功能分析可将序列大致分为分子功能、细胞成分和生物学过程三大类,其差异表达基因广泛涉及糖、脂类、蛋白质和核酸等生物大分子代谢、能量代谢以及次生代谢过程.在KEGG数据库中,依据代谢途径可将其定位在127个分支,包括植物-病原体互作、植物激素信号转导、RNA降解、ABC转运蛋白等,其中植物激素信号转导途径在不同时间处理下的变化都显著.转录因子分析发现在于旱胁迫下变化明显的转录因子家族包括MYB、bHLH、AP2\EREBP、WRKY和NAC等.对4个不同功能基因干旱胁迫后不同时间的表达量进行荧光定量分析,其变化趋势与转录组数据相同.