转录组测序分析猪胚胎附植的中期和后期卵巢差异表达基因

• 作者: 付言峰 任守文 周李生 方晓敏 李兰 李碧侠 王学敏 赵为民
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 胚胎附植 转录组测序 基因 表达
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 生物技术与繁殖
• 页码范围: 1879-1888
• 页数: 10页
• 分类号: S828.2
• 字数: 7897字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2018.09.009

摘要

胚胎附植是影响母猪产仔数的一个重要因素,本研究旨在找到猪胚胎附植的关键调控基因.选用5～7胎次梅山猪母猪4头,在其妊娠第18和24天分别屠宰2头,采集其卵巢组织进行转录组测序(RNA-seq)分析,GO功能富集分析及Pathway分析.结果表明:1)猪胚胎附植中期卵巢(卵_18 d)和后期卵巢(卵_24 d)两个组织样检测到的表达基因中最多的序列(reads)均为外显子序列;卵_18 d测得reads最多的染色体依次为6、14、1和7号,卵_24 d依次为1、7、14和M号;卵_24 d相较于卵_18 d有更多的基因表达,且表达量更高;两个时期卵巢组织中表达量前50位的基因中,线粒体基因占60％以上.2)卵_24 d相较于卵_18 d,有581个基因上调和103个基因下调,其中二者之间表达差异最大的基因为EN19684,位于线粒体中;表达差异最大的染色体基因为EN11278,位于14号染色体中.3)差异表达基因显著富集于内皮细胞活化等38个生物学过程,宿主细胞质等19个细胞学分区和FAD-AMP裂解酶活性等16个分子功能;差异表达基因在185条生物通路上存在差异,其中前3位极显著差异的生物通路依次为PI3K-Akt信号通路、Hippo信号通路和昼夜周期.综上表明,在卵巢组织表达的基因,重点参与了胚胎附植后期的调控,且高表达量基因多集中在细胞线粒体中,差异表达基因功能以内皮细胞活化为主,生物通路以PI3K-Akt信号通路为主.