2017年南京市2株肠道病毒71型分离株全基因组序列测定分析

• 作者: 余倩 张曾娣 王子鸣 黄赞
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 肠道病毒71型 全基因组 同源性分析 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 1095-1101,1118
• 页数: 8页
• 分类号: R373.2
• 字数: 5147字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2018.00.151

摘要

目的 对2017年南京市2株肠道病毒71型分离株进行全基因组序列测定,分析其进化及遗传变异特征,为手足口病疫情的监控与防治提供依据.方法 通过对临床检测EV71阳性的标本进行病毒分离,设计8对特异性引物对病毒全基因组进行PCR分段扩增,经序列测定及拼接获得EV71基因组序列,将其与其他代表毒株序列分别进行核苷酸和氨基酸同源性比对,并进行遗传进化分析.结果 基因组核苷酸同源性分析显示,2株分离株的同源性为94.0％.以EV71 NJ2017iso2作为参照,与2008年安徽流行株Fuyang 17.08-02的同源性最高(96.9％),而与原型株BrCr的同源性较低(79.8％).同时基于VP1基因和全基因组序列构建的进化树均可以看出,2株分离株与C4亚型代表株聚为一簇,与国内各地既往的C4流行毒株相比,未发生大的变异.结论 2株EV71分离株均属于C4a型,虽病毒核苷酸序列之间差异显著,但大多为无明显的突变,其相应的氨基酸序列的遗传变化相对稳定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张曾娣		2	0	0.0	0.0
2	王子鸣	南京农业大学动物科技学院消化道微生物研究室	1	0	0.0	0.0
3	余倩	南京农业大学动物科技学院消化道微生物研究室	2	1	1.0	1.0
4	黄赞	南京农业大学动物科技学院消化道微生物研究室	2	5	1.0	2.0