Enrich_analysis.pl,差异表达基因富集分析的perl脚本

• 作者: 李旭凯 王俊杰 王钇杰
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 医学
• 关键词: Enrich_analysis.pl perl脚本 富集分析 Fisher-s Exact Test 检验
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 178-183
• 页数: 6页
• 分类号: Q811.4|R857.3
• 字数: 3820字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12113/j.issn.1672-5565.201710001

摘要

如何从庞大的基因表达数据库里挖掘出有价值的信息,并做出科学的生物学诠释,是基因表达分析领域的重要挑战.富集分析为解决这一问题提出了合理的方案.用Perl语言写了一个脚本——Enrich_analysis.pl,可根据基因注释信息进行基因富集分析,并利用Fisher's Exact Test做检验.富集分析先根据生物学知识将基因归类,然后进行基因差异表达分析,提高数据的可解释性.并利用3篇SCI文章的差异基因数据,对本perl脚本进行了对比测试,证明本perl脚本算法正确可靠.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李旭凯	山西农业大学生命科学学院	9	2	1.0	1.0
4	王钇杰		2	3	1.0	1.0