杉木Cu/Zn-SOD基因克隆、序列特征及组织特异性表达

• 作者: 左丹丹 曹光球 林思祖 理挪 许珊珊 饶丽莎 黄田盛
• 来源期刊: 西北林学院学报
• 关键词: 杉木 Cu/Zn-SOD基因 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 林木遗传育种与培育
• 页码范围: 75-82
• 页数: 8页
• 分类号: S791.27
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7461.2018.02.12

摘要

超氧化物歧化酶是植物体中的重要金属酶,Cu/Zn-SOD在超氧化物歧化酶中比例最大,它能够清除细胞内的超氧阴离子,保护机体免受氧化损伤.Cu/Zn-SOD基因对植物的抗氧化性有重要的作用,目前已证实在烟草、玉米等作物在逆境下抗氧化能力有所提高,但在杉木中的Cu/ Zn-SOD基因功能尚未深入研究.本研究以杉木组培苗为材料,通过RT-PCR技术,获得一段461 bp的杉木Cu/Zn-SOD基因片段,运用生物信息学技术预测该基因蛋白的理化性质、亲疏水性、氨基酸组成、二三级结构、磷酸化结构及蛋白功能.结果表明,杉木Cu/Zn-SOD基因的ORF长度为312 bp,编码104个氨基酸,预测蛋白理论等电点为5.61,分子量为15.287 91 kD,是亲水性蛋白;同源氨基酸序列比对结果表明杉木Cu/Zn-SOD基因亚细胞定位预测该基因定位于细胞质内,Cu/Zn-SOD蛋白二三级结构无规则卷曲占取比例最大;预测未发现跨膜结构,在第18号氨基酸时为信号肽剪切位点,该蛋白属非分泌蛋白.杉木Cu/Zn-SOD基因的克隆对研究裸子植物及其分子机制具有重要意义,同时为植物Cu/Zn-SOD基因家族提供依据.