北京动物园3只亚成体大熊猫粪便菌群比较分析

• 作者: 刘学锋 刘燕 夏茂华 张成林 李林海 王曦 郑常明
• 来源期刊: 野生动物学报
• 关键词: 亚成体大熊猫 粪便菌群 多样性
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 19-23
• 页数: 5页
• 分类号: S858.9
• 语种: 中文

摘要

本试验的目的是采用高通量测序技术,研究北京动物园3只亚成体大熊猫肠道细菌的多样性,比较分析在其刚从成都回北京动物园饲养(14月龄)和饲养2个月后(16月龄)的粪便菌群差异,以及3只个体之间的差异.共采集新鲜粪便样品19份,提取DNA,然后用Illumina MiSeq平台测序分析.结果表明:3只亚成体大熊猫粪便细菌,在门水平上主要是变形菌门(Proteobacteria),平均占55.5％,厚壁菌门(Firmicutes)平均占42.5％;在属水平上,大肠志贺氏杆菌属(Escherichia shigella)平均占50.1％,狭义梭菌属(Clostridium sensu stricto)平均占13.8％,链球菌属(Streptococcus)平均占11.7％.在门到属的各级分类水平上,14月龄和16月龄的粪便菌群除了乳球菌属(Lactococcus)外,差异不显著(P＞0.05);3只个体之间菌群差异不显著(P＞0.05).