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狗枣猕猴桃叶绿体基因组微卫星特征分析
狗枣猕猴桃叶绿体基因组微卫星特征分析
作者:
业宁
吴东洋
周小亮
张礼
徐逸卿
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
狗枣猕猴桃
叶绿体基因组
微卫星
摘要:
利用NCBI数据库收录的狗枣猕猴桃(Actinidia kolomikta)叶绿体基因组序列,应用MISA工具对其序列中的微卫星进行查找并对其分布规律进行分析.结果表明:狗枣猕猴桃叶绿体中共有41个重复单元长度为1~6碱基的微卫星重复序列,主要分布在LSC和SSC区域.其中单碱基重复的微卫星单元最为丰富,共28个,占重复序列总数的68.3%;二碱基重复单元次之,约占重复序列总数的19.5%,三碱基重复单元和六碱基重复单元个数相同,均约占重复序列总数的4.9%;五碱基重复单元个数最少,约占2.4%.在单碱基重复、二碱基重复和三碱基重复类型中,A/T、AT/TA、AAT/ATT为最主要的重复单元.分析还发现,该研究结果中单碱基重复单元变化次数最高,说明在狗枣猕猴桃叶绿体基因组中重复单元较短的微卫星变异速率较快,而重复单元较长的微卫星变异速率较慢.研究结果可为开发猕猴桃属植物叶绿体通用引物提供理论依据.
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文献信息
篇名
狗枣猕猴桃叶绿体基因组微卫星特征分析
来源期刊
北方园艺
学科
农学
关键词
狗枣猕猴桃
叶绿体基因组
微卫星
年,卷(期)
2018,(9)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
30-35
页数
6页
分类号
S663.401
字数
语种
中文
DOI
10.11937/bfyy.20174592
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
吴东洋
南京林业大学林学院
14
85
5.0
9.0
5
业宁
南京林业大学信息科学技术学院
83
805
16.0
24.0
6
张礼
南京林业大学信息科学技术学院
6
3
1.0
1.0
7
徐逸卿
南京林业大学信息科学技术学院
16
13
2.0
3.0
8
周小亮
南京林业大学信息科学技术学院
1
2
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(27)
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引证文献
(2)
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(11)
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参考文献(0)
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二级引证文献(0)
2020(1)
引证文献(1)
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狗枣猕猴桃
叶绿体基因组
微卫星
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
北方园艺
主办单位:
黑龙江省农业科学院
黑龙江省园艺学会
黑龙江省农业科学院编辑出版中心
出版周期:
半月刊
ISSN:
1001-0009
CN:
23-1247/S
开本:
大16开
出版地:
黑龙江省哈尔滨市南岗区学府路368号省农科院
邮发代号:
14-150
创刊时间:
1977
语种:
chi
出版文献量(篇)
21038
总下载数(次)
74
总被引数(次)
103850
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