基于高通量测序的东海带鱼肠道菌群结构分析

• 作者: 傅荣兵 徐志进 李伟业 柳敏海 殷小龙 油九菊
• 来源期刊: 渔业研究
• 学科: 农学
• 关键词: 高通量测序 东海带鱼 肠道 菌群结构
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 论文与报告
• 页码范围: 434-440
• 页数: 7页
• 分类号: S931
• 字数: 3697字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14012/j.cnki.fjsc.2018.06.003

摘要

以东海带鱼为研究对象,利用高通量测序技术,分析了其肠道菌群结构特征.测序结果共获得36 129条有效序列,聚类到245个OUTs,有效序列中有4条序列(0.01％)无法进行物种分类,其余分属于16个细菌门,共77个科、127个属.在门的水平上,相对丰度最高的是变形菌门(Proteobacteria,52.30％),其次为厚壁菌门(Firmicutes,30.66％);在属的水平上,以弧菌科(Vibrionaceae,49.38％)的发光杆菌属(Photobacterium,47.90％)、梭菌科(Clostridiaceae_1,25.40％)的分节丝状菌(Candidatus_ Arthromitus,17.04％)为主.OTU稀释曲线逐渐趋于平缓,且覆盖率Good's Coverage指数为100％,表明样品测序深度足够大,OUT数量接近实际情况.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李伟业		16	37	4.0	6.0
2	傅荣兵		32	347	11.0	18.0
3	柳敏海		33	298	10.0	16.0
4	油九菊		9	28	3.0	5.0
5	徐志进		19	46	4.0	6.0
6	殷小龙		11	7	2.0	2.0