5个猪种HSD17B12基因结构变异SV225的多态性研究

• 作者: 冉雪琴 刘畅 卢圣菲 李升 牛熙 王嘉福 黄世会
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 HSD17B12 结构变异 多态性 产仔数
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 10-13
• 页数: 4页
• 分类号: S813.3
• 字数: 2551字
• 语种: 中文

摘要

基于香猪基因组重测序结果,发现HSD17B12基因内含子3中存在一个254 bp的结构变异位点,命名为SV225.为探索SV225在不同猪群体间多态性分布以及基因型与香猪产仔数的关系,选取4个贵州地方猪种(香猪、柯乐猪、江口萝卜猪、黔北黑猪)和1个欧洲猪种(大白猪)为动物样本,利用PCR检测5个猪种中结构变异SV225的分布频率.结果显示,4个贵州地方猪种中均检测到3种基因型:插入型Ⅱ,杂合型DI与缺失型DD,SV225多态性丰富,大白猪仅检测到Ⅱ型.4个贵州地方猪群相比,香猪和柯乐猪的D等位基因占优势,江口萝卜猪和黔北黑猪中Ⅰ等位基因比例更高.经卡方检验,香猪、柯乐猪的D等位基因频率显著高于江口萝卜猪和黔北黑猪(P＜0.01),且4个贵州地方猪种的D等位基因均显著高于大白猪(P＜0.01).分析3种基因型与香猪产仔数的关系,发现Ⅱ型个体的第三胎平均产仔数比DI型多2.25头(P＜0.01).本研究结果提示HSD17B12基因中的结构变异SV225与地方猪的产仔数可能存在一定的联系.